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CBETA 採用三種《卍續藏》版本的頁碼對照，這三種版本，按編輯完成時間先後，其順序如下：
Z: Zokuzokyo 《卍大日本續藏經》(卍續藏)。京都：藏經書院。
R: Reprint 《卍續藏經．新文豐影印本》。台北：新文豐。
X: Xuzangjing《卍新纂大日本續藏經》(卍新纂續藏)。東京：國書刊行會。CBETA 在引用經文的出處記錄上，採用以上三種版本並列，先《卍新纂續藏》（X），次《卍續藏》（Z），末（卍續藏經）（R）。以下就其格式及其相互間的計算方法，略述如下。
格式
計算方法
X（《卍新纂續藏經》） // Z（《卍續藏》） // R（《卍續藏經》）(CBETA, X78, no. 1553, p. 420, a4-5 // Z 2B:8, p. 298, a1-2 // R135, p. 595, a1-2)
以下逐一介紹說明。
原書採用「編．套．冊」（如二乙．二三．四）格式，共計三編(series)，合150套(set)，共750冊(volume)。每5冊合為一套(set)，每套約500-550張(leaf)，一張有四欄(panel)。一套之中各張依序編號，不同套則各自編號。編(series)、套(set)之間的關係為：
第一編：1-95套
第二編：1-32套
第二編乙：1-23套格式上，如「Z 2B:8, p. 298, a1-2」 ，表示：
《大日本續藏經》（《卍續藏》）第二編乙．第8套．第298張．第一欄．1-2行。這是以「編．套．張．欄．行」格式來記錄。
許多學者習慣加上冊數，如：
Z 1:19:5:418a （第一編第19套第5冊, leaf 418, panel a）
Z 2:19:1:16c （第二編第19套第1冊, leaf 16, panel c）
Z 2B:19:3:255d（第二編乙第19套第3冊, leaf 255, panel d）但因一套之中各冊「張」的序號不會重複，所以冊可以省略，作：
Z 1:19:418a （第一編第19套, leaf 418, panel a）
Z 2:19:16c （第二編第19套, leaf 16, panel c）
Z 2B:19:255d（第二編乙第19套, leaf 255, panel d）
台灣新文豐影印本，以前者（《大日本續藏經》）為底本，改以150冊雙欄發行， 每一冊對應到舊編(Z)一套：
第一編 1-95套 => R001 ~ S095
第二編 1-32套 => R096 ~ S127
第二編乙 1-23套 => R128 ~ S150格式上，如「 R135, p. 595, a1-2」，表示：
《卍續藏經》（台灣新文豐影印本）第135冊．595頁．上欄．1-2行。等同於「Z 2B:8, p. 298, a1-2」（《大日本續藏經》第二編乙．第八套．第298張．第一欄．1-2行）。
本版係由《大日本續藏經》、《日本校訂大藏經》中國撰述部，及若干新增補的典籍所成。經文有88冊，加上總目錄、索引、解題，計共90冊。版面一頁三欄，台灣有白馬影印本流通。
格式上，如「X78, no. 1553, p. 420, a4-5」，為：
《卍新纂大日本續藏經》第78冊．1553經．420頁．上欄．4-5行等同於上述「 Z 2B:8, p. 298, a1-2」或「R135, p. 595, a1-2」。
※本版新增若干經文，因此新增經文部分，其引用複製出處的資訊，便只列 X 版本。
目前 CBETA 經文資料庫，對於卍續藏的引用出處，以 X: 《卍新纂大日本續藏經》為基礎來記錄。
同一經文在 X 版本中為「每頁三欄（上、中、下）、每欄24行、每行20字」，在 R 版本中為「每頁兩欄（上、下）、每欄18行、每行20字」。兩者每行字數一致。所以同一經文中，只要是有文字的行，都可以找到 X 與 R 的對應行號。如：
X78n1553_p0420a10║R135_p0595a05
X78n1553_p0420a11║R135_p0595a06
X78n1553_p0420a12║R135_p0595a07
X78n1553_p0420a13║R135_p0595a08
X78n1553_p0420a14║R135_p0595a09但在卷或標題交界處， X 比 R 多出一些空白行，這些 X 空白行就沒有對應的 R 頁數及行號。如：
X78n1553_p0420a01║R135_pxxxxxxx
X78n1553_p0420a02║R135_pxxxxxxx
X78n1553_p0420a03║R135_pxxxxxxx
X78n1553_p0420a04║R135_p0595a01
X78n1553_p0420a05║R135_p0595a02上述的對照表是以程式計算，再加以人工除錯編輯而成。當中的格式，如「R135_p0595a01」 ，表示：卍續藏新文豐影印本第135冊．595頁．上欄．1行。
Z 分成三編，每一編含若干套。Z 的一套相當 R 的一冊，R 的冊數與 Z 的對照如下：
R001~R095 => Z 第一編 1-95套
R096~R127 => Z 第二編 1-32套
R128~R150 => Z 第二編乙 1-23套Z 的套中還分冊，但頁碼是以套為單位，所以冊可以省略。至於頁碼的對照，Z 是算 "張"(leaf)的，Z 的一張等於 R 的兩頁，所以 Z 的一張有四欄。也就是 R 的頁碼除以2，再加上餘數，就是 Z 的頁碼。R 的奇數頁是 Z 的 a,b 欄，而偶數頁是 Z 的 c,d 欄。行號，R 跟 Z 一樣。
如此規則的對照邏輯，正可以透過程式精確運算出來。如：
R135_p0595a01║Z2B:8_p0029a01
R135_p0595a02║Z2B:8_p0029a02
R135_p0595a03║Z2B:8_p0029a03
R135_p0595a04║Z2B:8_p0029a04如果要計算冊數，Z、R 兩者的冊數對照關係為：
Z 1:19:418a （Z 第一編第19套第5冊） => R019（R 第19冊）
Z 2:19:16c （Z 第二編第19套第1冊） => 19+95=R114（R 第114冊）
Z 2B:19:255d（Z 第二編乙第19套第3冊） => 19+127=R146（R 第146冊）
Z: 《大日本續藏經》（《卍續藏》）
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